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基于tcga数据库筛选与胃癌预后相关的差异基因

Screen differential genes related to prognosis of gastric cancer based on TCGA database

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收录情况: ◇ 统计源期刊

单位: [1]首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤中心 北京 100050 [2]首都医科大学附属北京友谊医院消化内科 国家消化系统疾病临床医学研究中心 首都医科大学消化病学系 北京 100050
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关键词: 胃癌 预后 生物标志物

摘要:
目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因。方法从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析。结果共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P (0. 05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关。结论通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病的早期诊断和靶向治疗提供分子层面的参考信息。

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第一作者单位: [1]首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤中心 北京 100050
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