目的了解和分析北京地区非结核分枝杆菌（NTM）的菌种分布及耐药情况。方法用PCR荧光探针法对北京结核病控制研究所菌株库中保存的2009年的1 552株和2013年的1 553株分枝杆菌菌株进行菌群鉴定,将所有鉴定为NTM的菌株用16S rRNA基因测序方法进行菌种鉴定,并用比例法对NTM菌株进行药敏试验。结果采用SPSS 13.0统计学软件进行统计分析。结果北京地区2009年和2013年NTM分离率分别为3.8%（59/1 552）和4.6%（71/1 553）。分离出的130株NTM菌株用16S rRNA基因测序进行鉴定,菌种为13种,其中胞内分枝杆菌占39.2%（51/130）,堪萨斯分枝杆菌占37.7%（49/130）,鸟分枝杆菌占6.9%（9/130）,脓肿分枝杆菌占5.4%（7/130）,偶然分枝杆菌占3.0%（4/130）,戈登分枝杆菌占1.5%（2/130）,蟾蜍分枝杆菌占1.5%（2/130）,瘰疬分枝杆菌、草分枝杆菌、耻垢分枝杆菌、母牛分枝杆菌、新金色分枝杆菌及熊本分枝杆菌各占0.8%（1/130）。130例NTM感染者中,男87例,女43例,平均年龄55岁,60岁及以上占40%（52/130）。比例法药敏试验结果显示,97株NTM对异烟肼和对氨基水杨酸耐药性最高,耐药率为98.0%（95/97）,其他依次为链霉素94.8%（92/97）,卷曲霉素81.4%（79/97）,阿米卡星69.1%（67/97）,左氧氟沙星56.7%（55/97）,利福平54.6%（53/97）,丙硫异烟胺51.5%（50/97）,乙胺丁醇50.5%（49/97）。结论北京地区NTM分离菌种以胞内分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌为主,NTM分离者以男性居多,NTM对常用的抗结核药物均具有较高的耐药性。