目的探讨在特定地区和时期内采用多位点可变串联重复序列（VNTR）分析（MLVA）对麻风菌基因分型,以评价麻风病传播链。方法从云南省丘北县2002—2006年收集的患者皮损中提取麻风菌DNA,采用AC9、6-7,GTA9,AT17,AC8a,AT15,AT18七个VNTR位点的MLVA基因分型,观察不同基因型与地理分布的关系;与现场流行病学调查结合,开展传播链的研究。结果（1）系统发育树分析揭示:依据GTA9等位基因型的变化,可分为GTA9位点为9,11-13,15-26,)26的A、B、C、D和E菌株。A菌株的GTA9等位基因型均为9,命名为A株。A株聚集分布在该县的北部,B株聚集分布在西北部,但C、D和E菌株基因型多变,散在分布。（2）该县北、西北部的5个高发家庭内的菌株为相同的A株。同一高发家庭内的患者,其菌株VNTR基因型一致或相似,但其他高发家庭之间的菌株基因型不相同。（3）在总菌株中,A菌株占有较高比例,且地理分布聚集,近期仍在传播。结论无论从家庭内或较小区域内收集菌株的分型结果显示,VNTR基因分型适合麻风菌分型和短传播链的研究。优势菌株或聚集株均为高发家系中发现的,因此推测高发家系可能作为乡村中的麻风菌的疫源和传染源。但需要较长时期证实A菌株是否为优势株。