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不同保存期单采血小板外泌体基因测序和蛋白组学的分析

Sequencing and Proteomic Analysis of Exosomes from Apheresis Platelets in Different Storage Periods

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资源类型:
Pubmed体系:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C

单位: [1]首都医科大学附属北京友谊医院输血科,北京100050 [2]解放军总医院第一医学中心输血科,北京100853
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ISSN:

关键词: 单采血小板 外泌体 基因测序 蛋白组学

摘要:
目的:明确不同保存期单采血小板(AP)外泌体基因测序和蛋白组学的差异变化,预测不同保存期AP外泌体的功能。方法:留取不同保存期D0、D3和D5的单采血小板,用高速离心法提取外泌体,进行基因测序和蛋白组学分析,生物信息学分析并预测血小板外泌体的生物学功能。液相质谱分析技术检测外泌体蛋白的变化和功能预测;制备小RNA测序文库,对构建好的文库进行测序和生物信息学技术数据分析。结果:AP外泌体i TRAQ蛋白分析显示,与D0相比,D3储存的AP外泌体有55个上调蛋白和94个下调蛋白(P(0.05,FC(0.83或FC)1.2),D5储存的AP外泌体有292个上调蛋白和53个下调蛋白(P(0.05,FC(0.83或FC)1.2)。KEGG通路分析结果表明,这些蛋白主要参与转运和代谢、免疫系统、癌症以及膜转运等过程。保存D0、D3和D5 AP释放的外泌体mi RNA相比具有明显的统计学差异(P(0.01),其中D3与D0的外泌体mi RNA相比,上调mi RNA数为374,下调mi RNA数为255;保存D5与D0的外泌体mi RNA相比,上调mi RNA数为297,下调mi RNA数为242;保存D5与D3的外泌体mi RNA相比,上调mi RNA数为252,下调mi RNA数为327。对差异外泌体mi RNA的靶基因进行GO富集分析,差异mi RNA的靶基因主要参与膜的组成,发挥与蛋白结合的分子功能,并参与转录调控的生物过程。结论:AP保存末期与初期相比外泌体差异蛋白和差异miRNA显著变化,分别参与多种的生物过程。

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第一作者:
第一作者单位: [1]首都医科大学附属北京友谊医院输血科,北京100050 [2]解放军总医院第一医学中心输血科,北京100853
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