目的：比较卡泊芬净和米卡芬净两种抗真菌药治疗侵袭性念珠菌病的有效性和经济性，为临床合理用药提供依据。方法：检索2000年1月至2022年1月PubMed、Embase、the Cochrane Library、中国知网、中国生物医学文献服务系统和万方数据库中相关文献，对卡泊芬净与米卡芬净治疗侵袭性念珠菌病的有效性和安全性进行Meta分析，根据直接医疗成本对两种药物治疗方案进行药物经济学评价，并通过敏感性分析验证结果的稳定性。结果：Meta分析共纳入4篇文献，其中2篇为随机对照研究，2篇为回顾性分析。Meta分析结果显示，卡泊芬净与米卡芬净治疗侵袭性念珠菌病的安全性、有效性相当，差异均无统计学意义（P)0.05）。最小成本法分析结果显示，卡泊芬净方案的成本为17 195.12元，米卡芬净方案的成本为13 601.35元，米卡芬净方案更具有经济学优势。结论：在我国，米卡芬净治疗成人侵袭性念珠菌病较卡泊芬净更具有经济性。