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nbs1基因snps与中国汉族人群原发性肝癌的遗传易感性

Association of Single Nucleotide Polymorphisms of NBS1 Gene With Genetic Susceptibility to Primary Liver Cancer in a Chinese Han Population

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资源类型:
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收录情况: ◇ SCIE ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C

单位: [1] 首都医科大学附属北京友谊医院实验中心/肝病中心 [2] 中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所全国肿瘤防治研究办公室 [3] 天津市传染病医院肝病科
出处:
ISSN:

关键词: 高分辨率SSCP分析 NBS1 单核苷酸多态性 原发性肝癌 遗传易感性

摘要:
为分析DNA损伤修复相关基因NBS1单核苷酸多态性(SNPs)与原发性肝癌遗传易感性的关系,并对高分辨率单链构象多态性(SSCP)检测技术在SNPs分型中的适用性进行评估,本研究对来自中国汉族人群的327例原发性肝癌以及295例阴性对照中NBS1基因常见SNPs的稀有等位基因频率进行检测和分析.此外,对NBS1基因6个常见SNPs分别选择部分样本同时进行直接序列测定,以比较2种方法的检测效果.119例原发性肝癌以及95例肝硬化/慢性肝炎组织标本的SSCP分析结果表明,6个常见NBS1基因SNPs位点(102G)A,320+208G/A,553G)C,1197T)C,2016A)G和2071-30A)T)中,SNP1197T)C的稀有等位基因频率为68.1%,显著高于肝硬化/慢性肝炎对照的57.9%(P=0.0298).对该SNP位点另外采用208份肝细胞癌和200份健康人群血液标本进一步分析,肝细胞癌SNP 1197T)C的稀有等位基因频率为66.8%,显著高于健康人群对照的58.8%(P=0.0170).其他5个SNPs的稀有等位基因频率在原发性肝癌与肝硬化/慢性肝炎之间均无显著性差异.高分辨率SSCP分析法与直接序列测定法对所选样本的SNPs基因分型结果完全一致,而且直接测序法对PCR扩增产物质量的要求相对高分辨率SSCP分析更高.研究表明,中国汉族人群NBS1基因SNP 1197T)C可能与原发性肝癌的发生相关,高分辨率SSCP技术准确度与直接测序法相当,且操作更加简便易行,非常适用于大量样本多个已知SNPs的基因分型.

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中科院(CAS)分区:
出版当年[2011]版:
大类 | 4 区 生物
小类 | 4 区 生化与分子生物学 4 区 生物物理
最新[2025]版:
大类 | 3 区 生物学
小类 | 3 区 生化与分子生物学 3 区 生物物理
JCR分区:
出版当年[2010]版:
Q4 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY Q4 BIOPHYSICS
最新[2023]版:
Q4 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY Q4 BIOPHYSICS

影响因子: 最新[2023版] 最新五年平均[2021-2025] 出版当年[2010版] 出版当年五年平均[2006-2010] 出版前一年[2009版] 出版后一年[2011版]

第一作者:
第一作者单位: [1] 首都医科大学附属北京友谊医院实验中心/肝病中心
推荐引用方式(GB/T 7714):

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