目的:了解云南、四川、贵州三省麻风菌株基因型的地理分布.方法:从云南省丘北县、四川省凉山州、贵州省兴义市分别采集59、21、31例麻风患者皮损活检,提取麻风菌DNA,对6-7、AC9、GTA9 3个数目可变的串联重复(variable-number tandem repeat,VNTR)位点的PCR产物测序,确定各位点重复序列数进行分型.结果:三省在6-7位点上有5种基因型,云南以7个拷贝的基因型为主,其它两地区的菌株在该位点的等位基因型为7、8、9,其分布无显著性差异.AC9位点上有4种基因型,三省均以8个拷贝的基因型为主.GTA9位点有非常明显的多样性.云南GTA9为9个拷贝的菌株占总菌株数的18.18%.结论:本研究结果提示麻风菌的基因型与地理分布有关.但需要以更多的位点,了解以VNTR为主的基因分型能否应用于麻风病的传染源和传播链的流行病学研究.