目的在同一细胞中通过免疫组化和荧光原位杂交联合检测特定标志物的蛋白和基因水平。方法采用人乳腺癌细胞系JIMT-1作为研究对象,分别采用免疫荧光（IF）和免疫组织化学（IHC）检测JIMT-1细胞中HER2表达情况,并比对两种方法得到的HER2蛋白细胞定位和表达水平是否相同;在JIMT-1细胞中分别采用IF和荧光原位杂交法（FISH）以及两者联合检测法检测HER2蛋白和基因表达水平;在JIMT-1细胞中对HER2、Pan-CK、Ki67蛋白和基因水平进行联合检测。结果 JIMT-1细胞中IF和IHC检测HER2蛋白水平和细胞定位相同;IF和FISH单独检测HER2蛋白和基因表达与两种方法联合使用的检测结果一致,IF和FISH联合检测不会影响HER2蛋白的细胞定位和表达水平的判读,同时对于HER2基因拷贝数判读无影响;通过对不同细胞定位的标志物检测,发现细胞膜、细胞浆和细胞核蛋白标志物均可联合FISH检测,并且不会影响标志物蛋白表达和定位的判读以及基因拷贝数的判读。结论采用IF和FISH联合检测可以在同一细胞中对特定标志物蛋白和基因水平同时检测。